【新手友好】用Pyspark和GraphX解析复杂网络数据
從零開始
在本文中,我們將詳細(xì)介紹如何在Python / pyspark環(huán)境中使用graphx進(jìn)行圖計(jì)算。GraphX是Spark提供的圖計(jì)算API,它提供了一套強(qiáng)大的工具,用于處理和分析大規(guī)模的圖數(shù)據(jù)。通過結(jié)合Python / pyspark和graphx,您可以輕松地進(jìn)行圖分析和處理。
為了方便那些剛?cè)腴T的新手,包括我自己在內(nèi),我們將從零開始逐步講解。
安裝Spark和pyspark
如果你只是想單獨(dú)運(yùn)行一下pyspark的演示示例,那么只需要擁有Python環(huán)境就可以了。你可以前往官方網(wǎng)站的快速開始頁面查看詳細(xì)的指南:https://spark.apache.org/docs/latest/api/python/getting_started/quickstart_df.html
安裝pyspark包
pip install pyspark
由于官方省略的步驟還是相當(dāng)多的,我簡單寫了一下我的成功演示示例。
from pyspark.sql import SparkSession,Row
from datetime import datetime, date
import pandas as pd
import os
os.environ['PYSPARK_PYTHON'] = "%你的Python包路徑%//python.exe"
spark = SparkSession.builder.getOrCreate()
df = spark.createDataFrame([
Row(a=1, b=2., c='string1', d=date(2000, 1, 1), e=datetime(2000, 1, 1, 12, 0)),
Row(a=2, b=3., c='string2', d=date(2000, 2, 1), e=datetime(2000, 1, 2, 12, 0)),
Row(a=4, b=5., c='string3', d=date(2000, 3, 1), e=datetime(2000, 1, 3, 12, 0))
])
df.show()
然而,考慮到我們今天需要使用GraphX進(jìn)行分析,因此我們?nèi)匀恍枰惭bSpark。
安裝Spark
請?jiān)L問Spark官方網(wǎng)站(https://spark.apache.org/downloads.html)以獲取適用于您操作系統(tǒng)的最新版本,并進(jìn)行下載。如果您覺得下載速度較慢,您還可以選擇使用國內(nèi)阿里鏡像進(jìn)行下載。為了方便起見,我已經(jīng)幫您找到了相應(yīng)的鏡像地址。
國內(nèi)阿里鏡像:https://mirrors.aliyun.com/apache/spark/spark-3.5.0/?spm=a2c6h.25603864.0.0.52d72104qIXCsH
請下載帶有hadoop的版本:spark-3.5.0-bin-hadoop3.tgz。解壓縮Spark壓縮包即可
配置環(huán)境變量
在安裝Spark之前,請務(wù)必記住需要Java環(huán)境。請確保提前配置好JAVA_HOME環(huán)境變量,這樣才能正常運(yùn)行Spark。
在windows上安裝Java和Apache Spark后,設(shè)置SPARK_HOME、HADOOP_HOME和PATH環(huán)境變量。如果你知道如何在windows上設(shè)置環(huán)境變量,請?zhí)砑右韵聝?nèi)容:
SPARK_HOME = C:\apps\opt\spark-3.5.0-bin-hadoop3
HADOOP_HOME = C:\apps\opt\spark-3.5.0-bin-hadoop3
在Windows上使用winutils.exe的Spark
在Windows上運(yùn)行Apache Spark時(shí),確保你已經(jīng)下載了適用于Spark版本的winutils.exe。winutils.exe是一個(gè)用于在Windows環(huán)境下模擬類似POSIX的文件訪問操作的工具,它使得Spark能夠在Windows上使用Windows特有的服務(wù)和運(yùn)行shell命令。
你可以從以下鏈接下載適用于你所使用的Spark版本的winutils.exe:https://github.com/kontext-tech/winutils/tree/master/hadoop-3.3.0/bin
請確保將下載的winutils.exe文件放置在Spark安裝目錄的bin文件夾下,以便Spark能夠正確地使用它來執(zhí)行Windows特有的操作。
Apache Spark shell
spark-shell是Apache Spark發(fā)行版附帶的命令行界面(CLI)工具,它可以通過直接雙擊或使用命令行窗口在Windows操作系統(tǒng)上運(yùn)行。此外,Spark還提供了一個(gè)Web UI界面,用于在Windows上進(jìn)行可視化監(jiān)控和管理。
請嘗試運(yùn)行Apache Spark shell。當(dāng)你成功運(yùn)行后,你應(yīng)該會看到一些內(nèi)容輸出(請忽略最后可能出現(xiàn)的警告信息)。
在啟動Spark-shell時(shí),它會自動創(chuàng)建一個(gè)Spark上下文的Web UI。您可以通過從瀏覽器中打開URL,訪問Spark Web UI來監(jiān)控您的工作。
GraphFrames
在前面的步驟中,我們已經(jīng)完成了所有基礎(chǔ)設(shè)施(環(huán)境變量)的配置?,F(xiàn)在,我們需要進(jìn)行一些配置來使Python腳本能夠運(yùn)行g(shù)raphx。
要使用Python / pyspark運(yùn)行g(shù)raphx,你需要進(jìn)行一些配置。接下來的示例將展示如何配置Python腳本來運(yùn)行g(shù)raphx。
GraphFrames的安裝
如需獲得更多關(guān)于GraphFrames的信息和快速入門指南,請?jiān)L問官方網(wǎng)站:https://graphframes.github.io/graphframes/docs/_site/quick-start.html。
你也可以使用以下命令來安裝GraphFrames。
pip install graphframes
在繼續(xù)操作之前,請務(wù)必將graphframes對應(yīng)的jar包安裝到spark的jars目錄中,以避免在使用graphframes時(shí)出現(xiàn)以下錯(cuò)誤:
java.lang.ClassNotFoundException: org.graphframes.GraphFramePythonAPI
將下載好的jar包放入你的%SPARK_HOME%\jars即可。
接下來,我們可以開始正常地使用graphx圖計(jì)算框架了?,F(xiàn)在,讓我們簡單地瀏覽一下一個(gè)示例demo。
from pyspark.sql.types import *
from pyspark.sql import SparkSession
from pyspark import SparkContext, SparkConf
import pandas as pd
from graphframes import GraphFrame
spark_conf = SparkConf().setAppName('Python_Spark_WordCount').setMaster('local[2]')
sc = SparkContext(conf=spark_conf)
spark=SparkSession.builder.appName("graph").getOrCreate()
v = spark.createDataFrame([
("a", "Alice", 34),
("b", "Bob", 36),
("c", "Charlie", 30),
], ["id", "name", "age"])
# Create an Edge DataFrame with "src" and "dst" columns
e = spark.createDataFrame([
("a", "b", "friend"),
("b", "c", "follow"),
("c", "b", "follow"),
], ["src", "dst", "relationship"])
# Create a GraphFrame
g = GraphFrame(v, e)
# Query: Get in-degree of each vertex.
g.inDegrees.show()
# Query: Count the number of "follow" connections in the graph.
g.edges.filter("relationship = 'follow'").count()
# Run PageRank algorithm, and show results.
results = g.pageRank(resetProbability=0.01, maxIter=20)
results.vertices.select("id", "pagerank").show()
如果運(yùn)行還是報(bào)錯(cuò):org.apache.spark.SparkException: Python worker failed to connect back
import os
os.environ['PYSPARK_PYTHON'] = "%你自己的Python路徑%//Python//python.exe"
最后大功告成:
網(wǎng)絡(luò)流量分析
接下來,我們將探討一下是否能夠?qū)W(wǎng)絡(luò)流量進(jìn)行分析。對于初學(xué)者來說,很難獲得一些有組織的日志文件或數(shù)據(jù)集,所以我們可以自己制造一些虛擬數(shù)據(jù),以便進(jìn)行演示。
首先,讓我來詳細(xì)介紹一下GraphFrame(v, e)的參數(shù):
參數(shù)v:Class,這是一個(gè)保存頂點(diǎn)信息的DataFrame。DataFrame必須包含名為"id"的列,該列存儲唯一的頂點(diǎn)ID。
參數(shù)e:Class,這是一個(gè)保存邊緣信息的DataFrame。DataFrame必須包含兩列,"src"和"dst",分別用于存儲邊的源頂點(diǎn)ID和目標(biāo)頂點(diǎn)ID。
edges=sc.textFile(r'/Users/xiaoyu/edges')
edges=edges.map(lambda x:x.split('\t'))
edges_df=spark.createDataFrame(edges,['src','dst'])
nodes=sc.textFile(r'/Users/xiaoyu/nodes')
nodes=nodes.map(lambda x:[x])
nodes_df=spark.createDataFrame(nodes,['id'])
graph=GraphFrame(nodes_df, edges_df)
為了創(chuàng)建圖數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)并進(jìn)行分析,可以簡化流程,直接讀取相關(guān)文件并進(jìn)行處理。
# 計(jì)算每個(gè)節(jié)點(diǎn)的入度和出度
in_degrees = graph.inDegrees
out_degrees = graph.outDegrees
# 打印節(jié)點(diǎn)的入度和出度
in_degrees.show()
out_degrees.show()
查找具有最大入度和出度的節(jié)點(diǎn):
# 找到具有最大入度的節(jié)點(diǎn)
max_in_degree = in_degrees.agg(F.max("inDegree")).head()[0]
node_with_max_in_degree = in_degrees.filter(in_degrees.inDegree == max_in_degree).select("id")
# 找到具有最大出度的節(jié)點(diǎn)
max_out_degree = out_degrees.agg(F.max("outDegree")).head()[0]
node_with_max_out_degree = out_degrees.filter(out_degrees.outDegree == max_out_degree).select("id")
# 打印結(jié)果
node_with_max_in_degree.show()
node_with_max_out_degree.show()
總結(jié)
本文介紹了如何在Python / pyspark環(huán)境中使用graphx進(jìn)行圖計(jì)算。通過結(jié)合Python / pyspark和graphx,可以輕松進(jìn)行圖分析和處理。首先需要安裝Spark和pyspark包,然后配置環(huán)境變量。接著介紹了GraphFrames的安裝和使用,包括創(chuàng)建圖數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)、計(jì)算節(jié)點(diǎn)的入度和出度,以及查找具有最大入度和出度的節(jié)點(diǎn)。最后,希望本文章對于新手來說有一些幫助~
總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的【新手友好】用Pyspark和GraphX解析复杂网络数据的全部內(nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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