基于Python和RDKit對化合物數(shù)據(jù)進行預處理。

 

環(huán)境

MolVS是專門用于化合物預處理的庫。

• rdkit 2020.03
• molvs 0.1.1

 

化合物（Compound）預處理

RDKit：SanitizeMol

Kekure的形成，化合價的確認，芳香性的設定，結合等。

參考：http://rdkit.org/docs/source/rdkit.Chem.rdmolops.html

 

MolVS : Normarize

參考：https://molvs.readthedocs.io/en/latest/guide/standardize.html

進行了一系列轉換，以修復常見錯誤并標準化特征組。

from rdkit import

總結

以上是生活随笔為你收集整理的RDKit | 基于RDKit 的化合物预处理的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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