lammps数据后处理:Python Ovito CNA结构统计输出
生活随笔
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lammps数据后处理:Python Ovito CNA结构统计输出
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
大家好,我是小馬老師。
本文介紹python統計并輸出CNA結構分析結果。
Ovito CNA模塊可以分析不同時刻的晶體結構,但是在ovito軟件中的分析結果不方便直接繪圖輸出,因此本文給出一個python腳本,運行之后可以直接繪制不同晶體結構的比例圖。
程序使用方法:
復制以下python代碼,保存為cna.py文件,和tension.xyz保存到一個文件夾中,使用命令行進入該文件夾,輸入命令:
python cna.py運行完成后會得到以上圖片。
對應的python代碼為:
from ovito.io import import_file from ovito.modifiers import CommonNeighborAnalysisModifier impo總結
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