Nature作图也出错 单细胞UMAP/TSNE图的ggplot做法与修饰
生活随笔
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Nature作图也出错 单细胞UMAP/TSNE图的ggplot做法与修饰
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復(fù)現(xiàn)Nature文章的圖表:
image.png
我們這里主要展示UMAP圖的ggplot做法,原文圖如下:
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復(fù)現(xiàn)效果如下:可以發(fā)現(xiàn),原文中3、15標(biāo)反了,可能原文作者使用PS添加的,或者cluster編號(hào)弄反了,可見nature文章也有粗心大意的錯(cuò)誤!
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主要解決的問題有:
1、ggplot繪制單細(xì)胞UMAP圖,設(shè)自定義細(xì)胞展示順序、細(xì)胞顏色2、ggplot繪制UMAP圖,添加cluster標(biāo)簽
3、ggplot實(shí)現(xiàn)UMAP圖坐標(biāo)軸在左下角的問題
4、實(shí)現(xiàn)legend圈中顯示cluster數(shù)字
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總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的Nature作图也出错 单细胞UMAP/TSNE图的ggplot做法与修饰的全部內(nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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