3.GraphPad图表分类
1.GraphPad Prism圖表組成
在Graphs (圖形)部分選擇合適的圖形后,會在工作區(qū)生成一個(gè)圖形 (如圖1),該圖形主要有六部分:圖標(biāo)題、Y軸、Y軸標(biāo)題、圖形繪制區(qū)、X軸、X軸標(biāo)題。
圖1
2.GraphPad Prism圖表分類
GraphPad Prism的圖表分類主要有8種:XY (XY表)、Column (縱列表)、Grouped (行列分組表)、Contingency (列聯(lián)表)、Survival (生存表)、Parts of whole (局部整體表)、Multiple variable (多變量表)和Nested (嵌套表)。
2.1 XY表
XY表中,每組數(shù)據(jù)由X值和Y值組成,它們共同定義數(shù)據(jù)的二維結(jié)構(gòu)。XY表既可以用于展示連續(xù)性數(shù)據(jù)(計(jì)量變量),也可以用于分類數(shù)據(jù)(二分類變量或多分類變量)。XY表可以繪制多種圖形,如散點(diǎn)圖、折線圖、直方圖、棒棒糖圖等,是GraphPad軟件中可繪制的圖形種類最多的數(shù)據(jù)表。XY數(shù)據(jù)表的右側(cè)引導(dǎo)界面主要有兩個(gè)可選擇的數(shù)據(jù)表(圖2、3):“在新的數(shù)據(jù)表中輸入或?qū)霐?shù)據(jù)”和“使用軟件自帶數(shù)據(jù)”。
圖2
圖3
XY表可繪制的圖形可分為3組共15種(圖4):
2.1.1 統(tǒng)計(jì)量圖組
它是將數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成統(tǒng)計(jì)量來表示的。有5種,分別是:(a)帶誤差線的散點(diǎn)圖; (b) 直線連接的帶誤差線的散點(diǎn)圖; ? 直線連接的誤差線圖; (d) 帶誤差線的柱狀圖; (e)帶誤差線的面積圖。
2.1.2 重復(fù)數(shù)據(jù)圖組
是同一個(gè)X值對應(yīng)多個(gè)重復(fù)列的Y值,形成X值相同的多個(gè)點(diǎn)。有5種圖形類型,分別是:(f) 重復(fù)點(diǎn)圖;(g) 直線連接的重復(fù)點(diǎn)圖;(h) 中位數(shù)或平均值直線連接的重復(fù)點(diǎn)圖;(i) 箱線圖;(j) 懸浮柱狀圖。
2.1.3 單數(shù)據(jù)圖組
該類圖是由單個(gè)X、Y值確定數(shù)據(jù)點(diǎn)。有5種圖形類型,分別是:(k) 散點(diǎn)圖;(l) 直線連接的散點(diǎn)圖;(m) 折線圖;(n) 柱狀圖;(o) 面積圖。
圖4
2.2 Column (縱列表)
縱列表也稱作一維分組表,其特征是只有一個(gè)分組變量,數(shù)據(jù)表中的每一列代表一個(gè)組別,且在行上沒有分組。在縱列表中,每一列可有相互獨(dú)立或相關(guān)的數(shù)據(jù),可以展示每列數(shù)據(jù)的分布和統(tǒng)計(jì)量。最常見的繪圖圖形是散點(diǎn)圖、柱狀圖、箱線圖和小提琴圖等。與XY表類似,縱列表的右側(cè)引導(dǎo)頁面也有兩個(gè)可選擇的數(shù)據(jù)表(圖5):“在新的數(shù)據(jù)表中輸入或?qū)霐?shù)據(jù)”和“使用軟件自帶數(shù)據(jù)”。
圖5
縱列表可繪制的圖形樣式有3組18種(圖6):
2.2.1 Individual value (個(gè)體值)
這類圖側(cè)重于數(shù)據(jù)展示,將原始數(shù)據(jù)以散點(diǎn)的形式表示出來。可分為三類圖,即:散點(diǎn)圖、帶柱形的散點(diǎn)圖和前后圖。
2.2.2 Box and violin (箱線圖和小提琴圖)
這類圖側(cè)重于展示數(shù)據(jù)的分布,將原始數(shù)據(jù)的分布或范圍以箱圖或小提琴圖的形式展示出來。
2.2.3 Mean/median & error (均數(shù)/中位數(shù)和誤差)
這類圖側(cè)重于展示每組數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)量,可展示每組數(shù)據(jù)的平均數(shù)、中位數(shù)、幾何均數(shù)、誤差等參數(shù)和統(tǒng)計(jì)量。
圖6
2.3 Grouped (行列分組表)
行列分組表也稱作二維分組表,即行和列都是分組因素(每一列定義一個(gè)組別,每一行定義一個(gè)組別)。行列分組表的數(shù)據(jù)輸入引導(dǎo)界面與上面的兩個(gè)表類似(圖7)。
圖7
行列分組表由于有兩個(gè)分組變量,因此可繪制的圖形種類較多,共有5組45種可繪制的圖形(圖8)。
2.3.1. Individual value (個(gè)體值)
該類有7種圖形,與縱列表相同,側(cè)重于展示數(shù)據(jù),將原始數(shù)據(jù)以散點(diǎn)或柱形圖的形式展示。從左到右依次為交錯(cuò)散點(diǎn)圖、分組散點(diǎn)圖、帶柱狀圖的交錯(cuò)散點(diǎn)圖,帶柱狀圖的分組散點(diǎn)圖、疊印散點(diǎn)圖、重復(fù)測量的配伍散點(diǎn)圖和重復(fù)測量的配伍堆積散點(diǎn)圖。
2.3.2.Summary data (數(shù)據(jù)匯總)
該類有14種圖形,主要通過柱狀圖和符號圖來整體展示數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)量。第一行從左到右依次為交錯(cuò)柱狀圖、分組柱狀圖、堆積柱狀圖,后三個(gè)為坐標(biāo)軸轉(zhuǎn)換;第二行從左到右依次為交錯(cuò)符號圖、分組符號圖、疊印符號圖和直線連接的疊印符號圖,后四個(gè)為坐標(biāo)軸轉(zhuǎn)換。
2.3.3.Heatmap (熱圖)
該類有8種圖形,用不同的顏色變化來展示數(shù)據(jù)信息,可以直觀的將數(shù)據(jù)值的大小以定義的顏色深淺表示出來。
2.3.4.Three-way (三因素方差分析)
該類有4種圖形,從左到右依次為直線連接的統(tǒng)計(jì)量圖、嵌套交錯(cuò)柱狀圖、嵌套疊印散點(diǎn)圖和嵌套并列散點(diǎn)圖。
2.3.5. Box and violin (箱線圖和小提琴圖)
該類有12種圖形,可分為交錯(cuò)和分組的箱線圖、小提琴圖。
圖8
2.4 Contingency (列聯(lián)表)
列聯(lián)表將觀察值按照兩個(gè)變量或多個(gè)變量分類列出,是一種特殊的頻數(shù)統(tǒng)計(jì)表,其不能展示計(jì)算后的統(tǒng)計(jì)量、小數(shù)或百分?jǐn)?shù)。GraphPad軟件可以輸入任意行列的R×C列聯(lián)表。其輸入界面如圖9所示。
圖9
列聯(lián)表可繪制6種圖形(圖10):與行列分組表中的交錯(cuò)、分組、堆積柱狀圖相似,不同之處在于,列聯(lián)表圖形不能展示誤差線。
圖10
2.5Survival (生存表)
生存表是為生存資料所設(shè)置的一類表格,主要用于生存分析和繪制生存曲線。數(shù)據(jù)輸入界面如圖11所示。
圖11
生存表可繪制4種圖形(圖12):
圖12 (a)及(e)所示的生存曲線為帶誤差線和刪失標(biāo)記的階梯圖,是最常用的生存曲線;(b)及(f)所示為不帶誤差線的直線連接的點(diǎn)圖;?及(g)所示為帶誤差線的直線連接的點(diǎn)圖;(d)及(h)所示為不帶誤差線但帶刪失標(biāo)記的階梯圖。
圖12
2.6 Parts of whole (局部整體表)
局部整體表的操作頁面簡單,其主要用來繪制餅圖。
局部整體表可繪制5種圖形(圖13),從左到右依次是餅圖、圓環(huán)圖、水平切片圖、垂直切片圖和百分比點(diǎn)圖。
圖13
2.7Multiple variable (多變量表)
多變量表的每一列代表一個(gè)變量,每一行代表一個(gè)個(gè)體或一次試驗(yàn)。它的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)與行列分組表類似,但多變量表不能設(shè)置子列。
多變量表的圖形菜單中只有一種圖形(圖14),即氣泡圖(Bubble plot)。但GraphPad軟件新增了主成分分析,可自動生成得分圖、載荷圖、碎石圖、雙標(biāo)圖和方差比例圖。
圖14
2.8 Nested (嵌套表)
嵌套表主要用于處理嵌套數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析和繪圖。嵌套表與縱列表類似,區(qū)別在于:縱列表的每一個(gè)子列代表一次重復(fù),每一列堆疊在一起的數(shù)據(jù)表示重復(fù)多次測量;而嵌套表每一行代表一次重復(fù),每一行的子列數(shù)據(jù)表示方法的重復(fù)使用。
嵌套表可繪制如下6種圖形(圖15),從左到右依次為散點(diǎn)圖、點(diǎn)柱圖(在散點(diǎn)圖的基礎(chǔ)上加上柱狀圖)、柱狀圖、高低圖、箱線圖、小提琴圖。
圖15
總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的3.GraphPad图表分类的全部內(nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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