這周開始用了一下 zotero。
這是一款非常好用的文獻管理工具，但它更像是一個多功能的收藏夾，或者說是一個知識、筆記、文獻的綜合管理工具。
入門的時候搜到了陽志平老師的幾個圖文并茂的教程，這里也推薦一下：http://www.yangzhiping.com/tech/zotero1.html

zotero concepts

zotero 最初是一個文獻工具，但它管理的最小單位是 item，每個 item 可以是網(wǎng)頁、書等，逐漸可以擴展為一個全能的知識工具。
一個單獨的 item 可以嵌入另一個 item 的下面，但已經(jīng)有嵌入條目的是不可以再嵌入別的條目下的。

實際的使用例子：

一個 blog 網(wǎng)頁可以作為單獨的 item
一個豆瓣圖書網(wǎng)頁可以作為一個 item，并且嵌入任意多個 URI 或者本地的 PDF 文件，可以是本書的全文或摘要或者習題答案
一個 Google Scholar 搜索結果的目標頁可以作為一個 item
一本單獨的書籍，或許在互聯(lián)網(wǎng)上沒有對應的描述URI，也可以建立一個 item，并填上對應的作者、出版社、年份等等

本文并不包含怎么用 zotero 比較好的討論，只是一些軟件使用細節(jié)上的介紹，避免后來人踩坑。

install

zotero 官網(wǎng)提供了各個平臺的下載鏈接，它可以運行于各操作系統(tǒng)甚至瀏覽器中。但是推薦使用獨立安裝(standalone)版本。
arch linux 下可以直接從 AUR 安裝。

為了便于收藏網(wǎng)頁，一般除了 standalone 版本，還要再裝一個瀏覽器插件，但是根據(jù)我自己實驗的結果， Firefox 版本要特別說明一下。

以 Firefox 方式安裝，是可以擁有 zotero 的全部功能的。
standalone 方式安裝后，如果再裝一個 firefox xpi 插件，實際上也會同樣裝上全功能的 firefox 版本，其他瀏覽器插件由于沒有原生的 zotero，所以不用擔心這里的問題。

通過下一節(jié)的恰當設置，可以讓 firefox 版本和 standalone 版本和諧共處。

configure

zotero 用戶文件內(nèi)容

zotero 的用戶數(shù)據(jù)一般來說包括幾個主要部分：

系統(tǒng)自己的配置，如首選項設置的保存文件
用戶的文獻庫的索引和結構等數(shù)據(jù)，保存在用戶文件夾里
用戶所有嵌入的 PDF 全文等文件，存放再上面的用戶文件夾下的 storage 文件夾中

第1個一般不用管理，哪怕重裝電腦丟了也不心疼。下面兩個需要做一些處理。

一般來說，為了方便配合各人電腦已有的分區(qū)管理，我們應該將用戶文件夾移動到某個位置，而不是默認的C:/Users/xxx/Documents/或者~/.zotero/blabla下面。

首先進入 zotero 的 Preference 中，切換到 Advanced - Files and Folders 下面。直接修改 Data Directory Location 為 Custom，并指定另一個位置，比如 ~/data/zotero。

這樣我們單機版的 zotero 就完成了，之后再正常使用即可。如果你需要多臺電腦同步，再看下面。

zotero 同步設置

zotero 有 sync 功能，可以同步上述2、3兩個文件夾。注冊一個官網(wǎng)帳號，然后到 Preference - Sync - Settings 中填上即可。

但是我們一般不希望 zotero 將上述3類 storage 文件夾也做同步。因為大量的 PDF 文件應該很大，而且 zotero 也沒有那么大的云空間，于是我們就有兩種處理方式了。

一種方法是，關閉 zotero 對附加文件夾的同步：回到上述 Sync - Settings 中取消下面的打勾。然后我們另外使用其他國內(nèi)的云盤，如百度云、堅果云等，將對應的 storage 文件夾納入同步就可以了。
在 *nix 系統(tǒng)下面有一個 trick，即可以將 storage 文件夾刪除，用一個 symbolic link 來替代它，這樣我們還可以進一步地自定義 storage 文件夾的位置和名稱，也照顧了云盤的使用、方便管理。
當然，如果在多臺電腦同步，那就在多臺電腦上都需要對云盤做類似設置。

另一種方法是，使用 zotero 的 WebDAV 方式同步。只需提供其他支持 WebDAV 的網(wǎng)盤即可，如堅果云，在堅果云后臺 “設置” - “安全” 中可以看到 WebDAV 的路徑，甚至可以設置一個單獨密碼，以便不用暴露堅果云的密碼到 zotero 中。
我們回到 zotero 中 Preference - Sync - Settings 下面下拉框中將 “Zotero” 改成 “WebDAV”，然后選默認 https，再填 “dav.jianguoyun.com/dav” 到后面的框中。下面的用戶名是堅果云的郵箱名，密碼是堅果云的密碼或者獨立密碼。使用 Verify Server 功能可以驗證是否成功。

這樣之后，zotero 會在堅果云賬戶里建立一個 zotero 的子文件夾(放心，不會包含URL路徑的dav字樣)。所有的 storage 內(nèi)容就會放到這里了，并且云盤上存的是經(jīng)過壓縮后的，而不像本地一樣是原始 PDF，不會占用太多云盤上的空間。同時，在堅果云客戶端中可以關閉對此文件夾的同步，因為我們并不關心此文件夾的結構和內(nèi)容，它就是一個給 zotero 專用的區(qū)域。

官方也有一些同步的建議: https://www.zotero.org/support/sync

firefox 插件

其他系統(tǒng)的插件如果沒有像 firefox 這樣功能完整的話，就避免了此處的問題，可以跳過此節(jié)。

首先需要關閉 zotero standalone 版本，再打開 firefox，按 Ctrl + Shift + Z 或者點插件圖標，會在火狐中打開一個類似 standalone 版本的下邊欄。

firefox 此時并不知道 standalone 版本的存在，需要點擊齒輪圖標，進入 Preference，可以看到插件本身的設置。然后將 Advanced - Files and Folders 下面的內(nèi)容，以及 Sync - Settings 下面的內(nèi)容，設置成和 standalone 版本完全一致。這樣二者就共用一個用戶文件夾了。

今后，如果 standalone 版本已經(jīng)打開，是無法啟動火狐插件的側邊欄的(估計是因為 zotero 對文件夾加了只讀鎖，不會允許多個 zotero 同時訪問以免數(shù)據(jù)庫被寫壞)。

然后照陽志平老師的文章里一樣，可以直接點導航欄上的圖標，或者右鍵點擊網(wǎng)頁，在所有支持了添加 zotero 條目的頁面上都可以將內(nèi)容添加到 zotero 庫了。

backup and recovery

雖然有 sync 功能，但是 zotero 官方還是推薦了采用原始方法進行備份，這也是對重要資料一種穩(wěn)妥的保護辦法。

備份時，只需定時拷貝整個用戶文件夾到別的地方，就可以了。

恢復時，關閉同步功能并退出程序，將備份文件夾內(nèi)容全部拷貝回來，再重新打開程序，就可以原樣恢復了。

但是，如果是徹底以本地備份為準，可能需要到 sync - reset 里抹去 zotero 服務器的備份。如果只是部分文件被修改，可以先在本地 duplicate item 部分條目，然后開啟 sync，服務器的版本會同步下來把本地的覆蓋掉，但是新 duplicate 出來的 item 是不會受影響的。這樣可以刪了被 sync 修改的，而新的 item 會自動 sync 回去。

具體可以看官方關于備份一節(jié): https://www.zotero.org/support/zotero_data

全文轉(zhuǎn)載自 It's calling me again

總結

以上是生活随笔為你收集整理的用 zotero 管理文献和个人知识库的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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