GSDS网站docker镜像本地构建的示例分析
生活随笔
收集整理的這篇文章主要介紹了
GSDS网站docker镜像本地构建的示例分析
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
這篇文章主要介紹GSDS網站docker鏡像本地構建的示例分析，文中介紹的非常詳細，具有一定的參考價值，感興趣的小伙伴們一定要看完！
GSDS網站docker鏡像本地構建
GSDS網站有時候打不開，可能服務器沒有人維護，原網站：http://gsds.cbi.pku.edu.cn/index.php 備用網站：http://gsds.gao-lab.org/index.php
這里為了方便大家使用GSDS，繪制基因結構圖，組學大講堂免費提供一個鏡像使大家可以在自己的電腦上搭建一個GSDS網站，這樣就永遠不會打不開網站了，具體方法如下：
搭建網站系統環境：
操作系統：win10教育版，
docker：docker桌面版本
1.下載組學大講堂提供的專門為GSDS定制的docker鏡像
>dockersearchomicsclass#搜索鏡像 NAMEDESCRIPTIONSTARSOFFICIALAUTOMATED omicsclass/gene-familygene-familyanalysisdockerimage4 omicsclass/rnaseqRNA-seqanalysisdockerimagebuildbyomics…3 omicsclass/reseqwholegenomeresequenceanalysis1 omicsclass/blast-plusblast+v2.9.00 omicsclass/biocontainer-baseBiocontainersbaseImagecentos70 omicsclass/isoseq3isoseq3v3.3.0buildbyomicsclass0 omicsclass/bwaBWAv0.7.17buildbyomicsclass0 omicsclass/samtoolssamtoolsv1.10buildbyomicsclass0 omicsclass/blastalllegacyblastallv2.2.260 omicsclass/sratoolkitSRAtoolkitv2.10.3andasperav3.9.9.1778720 omicsclass/ampliseq-q2Ampliconsequencingqiime2v2020.2image0 omicsclass/bsaseqNGSBulkSegregantAnalysisimage0 omicsclass/ampliseq-q1Ampliconsequencingqiime1v1.9.1image0 omicsclass/gwasgwasanalysisimages0 >dockerpullomicsclass/gsds-v2#下載鏡像
2.下載GSDS網站源代碼下載：gsds_v2.zip ，然后解壓文件到一個目錄：
我這里解壓到了：D:\gsds_v2
3.啟動docker鏡像：
>#查看后臺鏡像 REPOSITORYTAGIMAGEIDCREATEDSIZE omicsclass/gsds-v2latestd77e054c37448hoursago2.54GB mattrayner/lamplatest05750cfa54d55daysago915MB omicsclass/bsaseqlatestd5ed7a70bfc813daysago9.77GB omicsclass/reseqv1.1da154448a90f4weeksago8.83GB omicsclass/gene-familyv1.02d1d640726dd3monthsago4.53GB >#后臺啟動docker網站服務器，注意目錄映射-v參數，解壓的目錄D:\gsds_v2
4.打開網站使用本地GSDS網站：
網站本地地址：127.0.0.1 ，如果網站沒有打開，可以稍等一下，后臺服務啟動需要時間；
總結
以上是生活随笔為你收集整理的GSDS网站docker镜像本地构建的示例分析的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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