amt630a芯片中文资料_甲基化芯片学习记录
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                                ?今天是生信星球陪你的第539天
? ?大神一句話,菜鳥跑半年。我不是大神,但我可以縮短你走彎路的半年~
? ?就像歌兒唱的那樣,如果你不知道該往哪兒走,就留在這學點生信好不好~
? ?這里有豆豆和花花的學習歷程,從新手到進階,生信路上有你有我!
第一部分,學習甲基化的基礎知識,參考資料:
甲基化的基礎知識
第二部分,甲基化芯片分析的一般流程,包括了甲基化信號值的概念,可以做什么分析等,參考資料:
甲基化芯片的一般分析流程
第三部分 Bioconductor的代碼流程
主要是使用了R包minfi做質控和標準化。
中文導讀:Bioconductor的DNA甲基化芯片分析流程
原文網址:http://www.bioconductor.org/help/workflows/methylationArrayAnalysis/
最后曾老板給的標準流程,包括數據下載、質控及差異分析、富集分析,香!
數據下載:甲基化芯片數據下載如何讀入到R里面
質控:甲基化芯片數據的一些質控指標
一個甲基化芯片信號值矩陣差異分析的標準代碼
學完這些對甲基化芯片有了一定的了解,還需要多看些文獻,加油!
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生信零基礎入門學習小組長期報名中
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再給生信技能樹打個call!
一起來學單細胞
全球公益巡講、招學徒
如果需要提問,請務必先看生信星球答疑公告
總結
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