再怎么強(qiáng)調(diào)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析學(xué)習(xí)過程的計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)知識(shí)的打磨都不為過，我把它粗略的分成基于R語言的統(tǒng)計(jì)可視化，以及基于Linux的NGS數(shù)據(jù)處理：

• 《生信分析人員如何系統(tǒng)入門R(2019更新版)》
• 《生信分析人員如何系統(tǒng)入門Linux(2019更新版)》

把R的知識(shí)點(diǎn)路線圖搞定，如下：

• 了解常量和變量概念
• 加減乘除等運(yùn)算(計(jì)算器)
• 多種數(shù)據(jù)類型(數(shù)值，字符，邏輯，因子)
• 多種數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)(向量，矩陣，數(shù)組，數(shù)據(jù)框，列表)
• 文件讀取和寫出
• 簡單統(tǒng)計(jì)可視化
• 無限量函數(shù)學(xué)習(xí)

Linux的6個(gè)階段也跨越過去 ，一般來說，每個(gè)階段都需要至少一天以上的學(xué)習(xí)：

• 第1階段：把linux系統(tǒng)玩得跟Windows或者M(jìn)acOS那樣的桌面操作系統(tǒng)一樣順暢，主要目的就是去可視化，熟悉黑白命令行界面，可以僅僅以鍵盤交互模式完成常規(guī)文件夾及文件管理工作。
• 第2階段：做到文本文件的表格化處理，類似于以鍵盤交互模式完成Excel表格的排序、計(jì)數(shù)、篩選、去冗余，查找，切割，替換，合并，補(bǔ)齊，熟練掌握awk,sed,grep這文本處理的三駕馬車。
• 第3階段：元字符，通配符及shell中的各種擴(kuò)展，從此linux操作不再神秘！
• 第4階段：高級(jí)目錄管理：軟硬鏈接，絕對(duì)路徑和相對(duì)路徑，環(huán)境變量。
• 第5階段：任務(wù)提交及批處理，腳本編寫解放你的雙手。
• 第6階段：軟件安裝及conda管理，讓linux系統(tǒng)實(shí)用性放飛自我。

考慮到絕大部分粉絲即使購買了對(duì)應(yīng)的書籍仍然是需要視頻課程帶入門，這里我推薦阿里云大學(xué)和騰訊云大學(xué)的公開課給大家。

首先看騰訊云大學(xué)的Linux入門

之前我們生信菜鳥團(tuán)已經(jīng)發(fā)布的：購買入門級(jí)服務(wù)器免費(fèi)送Linux直播培訓(xùn)服務(wù) 其實(shí)就提到過了這個(gè)騰訊云大學(xué)，就是無需購買10塊錢的云服務(wù)器就可以學(xué)Linux的騷操作，因?yàn)槭寝厄v訊的羊毛，而且還有免費(fèi)的教學(xué)，都是他們的工程師。我以前推薦學(xué)生做這個(gè)，https://cloud.tencent.com/developer/labs/lab/10000 點(diǎn)擊進(jìn)入就是一個(gè)免費(fèi)的服務(wù)器，可以使用幾個(gè)小時(shí)， 足夠你跟著他們的免費(fèi)教學(xué)視頻入門Linux啦！

騰訊云大學(xué)的Linux入門

教學(xué)視頻在：https://cloud.tencent.com/edu/learning/course-1676-12066

大家可以直接從第3章開始學(xué)習(xí)，常規(guī)文件夾及文件管理基礎(chǔ)命令不多

ls?##?list?列出當(dāng)前路徑下信息
pwd?##?print?working?directory?打印工作目錄，即當(dāng)前所在目錄
cd?##?change?directory?切換目錄
mkdir?##?make?directory建立一個(gè)新的目錄
touch?##?創(chuàng)建文本
mv?##?Move?更改文件或目錄，移動(dòng)目錄或文件
rm?##?ReMove?刪除目錄或文件
cp?##?copy?and?paste?將給出的文件或目錄復(fù)制到另一個(gè)文件或目錄中?tar?##?Tape?archive?解壓文件
ln?##?LINk?鏈接文件

3. 基操之常用命令

• 3.1 章節(jié)介紹
• 3.2 Linux命令幫助文檔的使用
• 3.3 文件目錄創(chuàng)建及切換等命令
• 3.4 相對(duì)路徑和絕對(duì)路徑
• 3.5 文件目錄命名規(guī)則
• 3.6 ls命名詳解
• 3.7 文件目錄拷貝命令
• 3.8 重命名及移動(dòng)命令
• 3.9 文件目錄刪除命令
• 3.10 文件內(nèi)容查看命令
• 3.11 軟鏈接和硬鏈接
• 3.12 history命令
• 3.13 echo命令完成覆蓋和追加內(nèi)容
• 3.14 文件命令綜合案例
• 3.15 時(shí)間命令
• 3.16 tar打包及解壓
• 3.17 tar結(jié)合gzip壓縮
• 3.18 tar結(jié)合bzip2
• 3.19 壓縮在大數(shù)據(jù)中的使用詳解
• 3.20 系統(tǒng)命令實(shí)操

4. 文本編輯上古神器之VIM

• 4.1 章節(jié)介紹
• 4.2 VIM神器概述
• 4.3 VIM工作模式
• 4.4 VIM插入命令
• 4.5 VIM定位命令
• 4.6 VIM刪除命令
• 4.7 VIM復(fù)制粘貼命令
• 4.8 VIM替換和取消命令
• 4.9 VIM退出命令

5. 愛恨情仇之用戶、 用戶組及權(quán)限管理

• 5.1 章節(jié)介紹
• 5.2 Linux安全性模型
• 5.3 用戶詳解
• 5.4 用戶組詳解
• 5.5 用戶管理
• 5.6 用戶組管理
• 5.7 Linux文件和目錄的權(quán)限解讀
• 5.8 權(quán)限管理實(shí)操之字符表示法
• 5.9 權(quán)限管理實(shí)操之?dāng)?shù)字表示法
• 5.10 權(quán)限管理實(shí)操之賦予可執(zhí)行權(quán)限

6. 行走江湖之常用軟件安裝

• 6.1 章節(jié)介紹
• 6.2 Linux軟件安裝概述
• 6.3 RPM方式軟件安裝實(shí)操
• 6.4 YUM方式軟件安裝實(shí)操
• 6.5 JDK安裝實(shí)操
• 6.6 Tomcat安裝實(shí)操

6.7 MySQL安裝實(shí)操

課程總結(jié)

7.1 Linux 基礎(chǔ)入門

當(dāng)然了，這個(gè)只能說是簡單的認(rèn)識(shí)Linux，如果你想精通，還是建議購買一個(gè)最低配服務(wù)器，跟著練習(xí)。

再看阿里云大學(xué)的R語言

之所以注意到阿里云大學(xué)，還是我復(fù)旦大學(xué)的一個(gè)學(xué)徒提到的，因?yàn)樗齾⒓恿宋覀兩偶寄軜涞?strong>生信入門后，覺得可以吊打阿里云大學(xué)的R語言五條街！

鏈接是：

• https://edu.aliyun.com/course/27/lesson/list?spm=5176.8764728.aliyun-edu-course-tab.2.66642371X3S98U

學(xué)習(xí)量和播放量是沒的說！

阿里云大學(xué)的R語言

課程目錄如下：

• 課時(shí)1：R語言是什么、R的優(yōu)勢(shì)、資源16:08
• 課時(shí)2：R的安裝、獲取幫助、工作空間管理23:35
• 課時(shí)3：R包的使用、結(jié)果的重用、如何處理大數(shù)據(jù)集23:43
• 課時(shí)4：R數(shù)據(jù)集的概念、向量、矩陣和數(shù)組27:43
• 課時(shí)5：R數(shù)據(jù)框、因子和列表24:51
• 課時(shí)6：R的常用命令17:38
• 課時(shí)7：R的list列表詳解15:19
• 課時(shí)8：R的數(shù)據(jù)源導(dǎo)入方法22:41
• 課時(shí)9：R的用戶自定義函數(shù)14:05
• 課時(shí)10：R訪問MySQL數(shù)據(jù)庫13:01
• 課時(shí)11：R的集成開發(fā)環(huán)境(IDE)--Rstudio17:49
• 課時(shí)12：R如何畫圖，圖形參數(shù)、符號(hào)、線條和顏色25:10
• 課時(shí)13：R圖形的文本屬性、尺寸、標(biāo)題和自定義坐標(biāo)軸36:38
• 課時(shí)14：R圖形的次要刻度線、參考線、圖例和文本標(biāo)注30:25
• 課時(shí)15：R的圖形組合、圖形布局的精細(xì)控制30:57
• 課時(shí)16：R基本的數(shù)據(jù)管理--創(chuàng)建變量、變量重編碼和重命名21:43
• 課時(shí)17：R基本數(shù)據(jù)管理--如何處理缺失值、日期值得使用、數(shù)據(jù)類型轉(zhuǎn)換30:14
• 課時(shí)18：R基本數(shù)據(jù)管理--數(shù)據(jù)集合并、子集的提取以及隨機(jī)抽樣函數(shù)22:23
• 課時(shí)19：R高級(jí)數(shù)據(jù)管理--數(shù)學(xué)函數(shù)、統(tǒng)計(jì)函數(shù)和概率函數(shù)21:19
• 課時(shí)20：R高級(jí)數(shù)據(jù)管理--字符處理函數(shù)、將函數(shù)應(yīng)用于矩陣和數(shù)據(jù)框17:49
• 課時(shí)21：R高級(jí)數(shù)據(jù)管理--重復(fù)和循環(huán)、條件執(zhí)行、轉(zhuǎn)置19:24
• 課時(shí)22：R基本圖形--條形圖(堆砌、分組、均值)、條形圖的微調(diào)26:36
• 課時(shí)23：R的基本圖形——餅圖17:04
• 課時(shí)24：R基本圖形--直方圖09:55
• 課時(shí)25：R基本圖形--核密度圖10:05
• 課時(shí)26：R基本圖形——箱線圖08:27
• 課時(shí)27：R實(shí)例——預(yù)測海藻數(shù)量之問題描述與目標(biāo)、數(shù)據(jù)集格式16:12
• 課時(shí)28：R實(shí)例——預(yù)測海藻數(shù)量之?dāng)?shù)據(jù)預(yù)處理17:47
• 課時(shí)29：R實(shí)例——預(yù)測海藻數(shù)量之獲取預(yù)測模型12:37
• 課時(shí)30：R實(shí)例——預(yù)測海藻數(shù)量之模型的精簡和調(diào)優(yōu)

還等什么呢，趕快去學(xué)習(xí)體驗(yàn)對(duì)比一下哦！

學(xué)習(xí)后可以試試看我們的周末班全套練習(xí)題：

R語言的練習(xí)題

• 初級(jí)10 個(gè)題目，盡量根據(jù)參考代碼理解及完成：http://www.bio-info-trainee.com/3793.html
• 中級(jí)要求是：http://www.bio-info-trainee.com/3750.html
• 高級(jí)要求是完成20題：http://www.bio-info-trainee.com/3415.html
• 統(tǒng)計(jì)專題 30題：http://www.bio-info-trainee.com/4385.html
• 可視化專題30題：http://www.bio-info-trainee.com/4387.html

LINUX的練習(xí)題：

• 最低要求是完成我的 linux 20題 http://www.bio-info-trainee.com/2900.html
• 其次完成生物信息學(xué)數(shù)據(jù)格式的習(xí)題(blast/blat/fa-fq/sam-bam/vcf/bed/gtf-gff)，收集這些格式的說明書。
• fasta和fastq格式文件的shell小練習(xí) http://www.bio-info-trainee.com/3575.html
• sam和bam格式文件的shell小練習(xí) http://www.bio-info-trainee.com/3578.html
• VCF格式文件的shell小練習(xí) http://www.bio-info-trainee.com/3577.html

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的大学计算机基础知识点_阿里云大学和腾讯云大学的计算机基础课程的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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