【算法竞赛学习】学术前沿趋势-论文代码统计
任務(wù)3:論文代碼統(tǒng)計(jì)
3.1 任務(wù)說(shuō)明
- 任務(wù)主題:論文代碼統(tǒng)計(jì),統(tǒng)計(jì)所有論文出現(xiàn)代碼的相關(guān)統(tǒng)計(jì);
- 任務(wù)內(nèi)容:使用正則表達(dá)式統(tǒng)計(jì)代碼連接、頁(yè)數(shù)和圖表數(shù)據(jù);
- 任務(wù)成果:學(xué)習(xí)正則表達(dá)式統(tǒng)計(jì);
3.2 數(shù)據(jù)處理步驟
在原始arxiv數(shù)據(jù)集中作者經(jīng)常會(huì)在論文的comments或abstract字段中給出具體的代碼鏈接,所以我們需要從這些字段里面找出代碼的鏈接。
- 確定數(shù)據(jù)出現(xiàn)的位置;
- 使用正則表達(dá)式完成匹配;
- 完成相關(guān)的統(tǒng)計(jì);
3.3 正則表達(dá)式
正則表達(dá)式(regular expression)描述了一種字符串匹配的模式(pattern),可以用來(lái)檢查一個(gè)串是否含有某種子串、將匹配的子串替換或者從某個(gè)串中取出符合某個(gè)條件的子串等。
3.3.1 普通字符:大寫(xiě)和小寫(xiě)字母、所有數(shù)字、所有標(biāo)點(diǎn)符號(hào)和一些其他符號(hào)
| [ABC] | 匹配 […] 中的所有字符,例如 [aeiou] 匹配字符串 “google runoob taobao” 中所有的 e o u a 字母。 |
| [^ABC] | 匹配除了 […] 中字符的所有字符,例如 [^aeiou] 匹配字符串 “google runoob taobao” 中除了 e o u a 字母的所有字母。 |
| [A-Z] | [A-Z] 表示一個(gè)區(qū)間,匹配所有大寫(xiě)字母,[a-z] 表示所有小寫(xiě)字母。 |
| . | 匹配除換行符(\n、\r)之外的任何單個(gè)字符,相等于 [^\n\r]。 |
| [\s\S] | 匹配所有。\s 是匹配所有空白符,包括換行,\S 非空白符,包括換行。 |
| \w | 匹配字母、數(shù)字、下劃線。等價(jià)于 [A-Za-z0-9_] |
3.3.2 特殊字符:有特殊含義的字符
| ( ) | 標(biāo)記一個(gè)子表達(dá)式的開(kāi)始和結(jié)束位置。子表達(dá)式可以獲取供以后使用。要匹配這些字符,請(qǐng)使用 ( 和 )。 |
| * | 匹配前面的子表達(dá)式零次或多次。要匹配 * 字符,請(qǐng)使用 *。 |
| + | 匹配前面的子表達(dá)式一次或多次。要匹配 + 字符,請(qǐng)使用 +。 |
| . | 匹配除換行符 \n 之外的任何單字符。要匹配 . ,請(qǐng)使用 . 。 |
| [ | 標(biāo)記一個(gè)中括號(hào)表達(dá)式的開(kāi)始。要匹配 [,請(qǐng)使用 [。 |
| ? | 匹配前面的子表達(dá)式零次或一次,或指明一個(gè)非貪婪限定符。要匹配 ? 字符,請(qǐng)使用 ?。 |
| \ | 將下一個(gè)字符標(biāo)記為或特殊字符、或原義字符、或向后引用、或八進(jìn)制轉(zhuǎn)義符。例如, ‘n’ 匹配字符 ‘n’。’\n’ 匹配換行符。序列 ‘\’ 匹配 “”,而 ‘(’ 則匹配 “(”。 |
| ^ | 匹配輸入字符串的開(kāi)始位置,除非在方括號(hào)表達(dá)式中使用,當(dāng)該符號(hào)在方括號(hào)表達(dá)式中使用時(shí),表示不接受該方括號(hào)表達(dá)式中的字符集合。要匹配 ^ 字符本身,請(qǐng)使用 ^。 |
| { | 標(biāo)記限定符表達(dá)式的開(kāi)始。要匹配 {,請(qǐng)使用 {。 |
| | | 指明兩項(xiàng)之間的一個(gè)選擇。要匹配 |,請(qǐng)使用 |。 |
3.3.3 限定符
| * | 匹配前面的子表達(dá)式零次或多次。例如,zo* 能匹配 “z” 以及 “zoo”。* 等價(jià)于{0,}。 |
| + | 匹配前面的子表達(dá)式一次或多次。例如,‘zo+’ 能匹配 “zo” 以及 “zoo”,但不能匹配 “z”。+ 等價(jià)于 {1,}。 |
| ? | 匹配前面的子表達(dá)式零次或一次。例如,“do(es)?” 可以匹配 “do” 、 “does” 中的 “does” 、 “doxy” 中的 “do” 。? 等價(jià)于 {0,1}。 |
| {n} | n 是一個(gè)非負(fù)整數(shù)。匹配確定的 n 次。例如,‘o{2}’ 不能匹配 “Bob” 中的 ‘o’,但是能匹配 “food” 中的兩個(gè) o。 |
| {n,} | n 是一個(gè)非負(fù)整數(shù)。至少匹配n 次。例如,‘o{2,}’ 不能匹配 “Bob” 中的 ‘o’,但能匹配 “foooood” 中的所有 o。‘o{1,}’ 等價(jià)于 ‘o+’。‘o{0,}’ 則等價(jià)于 ‘o*’。 |
| {n,m} | m 和 n 均為非負(fù)整數(shù),其中n <= m。最少匹配 n 次且最多匹配 m 次。例如,“o{1,3}” 將匹配 “fooooood” 中的前三個(gè) o。‘o{0,1}’ 等價(jià)于 ‘o?’。請(qǐng)注意在逗號(hào)和兩個(gè)數(shù)之間不能有空格。 |
3.4 具體代碼實(shí)現(xiàn)以及講解
首先我們來(lái)統(tǒng)計(jì)論文頁(yè)數(shù),也就是在comments字段中抽取pages和figures和個(gè)數(shù),首先完成字段讀取。
data = [] #初始化 #使用with語(yǔ)句優(yōu)勢(shì):1.自動(dòng)關(guān)閉文件句柄;2.自動(dòng)顯示(處理)文件讀取數(shù)據(jù)異常 with open("arxiv-metadata-oai-snapshot.json", 'r') as f: for idx, line in enumerate(f): d = json.loads(line)d = {'abstract': d['abstract'], 'categories': d['categories'], 'comments': d['comments']}data.append(d)data = pd.DataFrame(data) #將list變?yōu)閐ataframe格式,方便使用pandas進(jìn)行分析對(duì)pages進(jìn)行抽取:
# 使用正則表達(dá)式匹配,XX pages data['pages'] = data['comments'].apply(lambda x: re.findall('[1-9][0-9]* pages', str(x)))# 篩選出有pages的論文 data = data[data['pages'].apply(len) > 0]# 由于匹配得到的是一個(gè)list,如['19 pages'],需要進(jìn)行轉(zhuǎn)換 data['pages'] = data['pages'].apply(lambda x: float(x[0].replace(' pages', '')))對(duì)pages進(jìn)行統(tǒng)計(jì):
data['pages'].describe().astype(int)統(tǒng)計(jì)結(jié)果如下:論文平均的頁(yè)數(shù)為17頁(yè),75%的論文在22頁(yè)以?xún)?nèi),最長(zhǎng)的論文有11232頁(yè)。
count 1089180 mean 17 std 22 min 1 25% 8 50% 13 75% 22 max 11232 Name: pages, dtype: int64接下來(lái)按照分類(lèi)統(tǒng)計(jì)論文頁(yè)數(shù),選取了論文的第一個(gè)類(lèi)別的主要類(lèi)別:
# 選擇主要類(lèi)別 data['categories'] = data['categories'].apply(lambda x: x.split(' ')[0]) data['categories'] = data['categories'].apply(lambda x: x.split('.')[0])# 每類(lèi)論文的平均頁(yè)數(shù) plt.figure(figsize=(12, 6)) data.groupby(['categories'])['pages'].mean().plot(kind='bar')接下來(lái)對(duì)論文圖表個(gè)數(shù)進(jìn)行抽取:
data['figures'] = data['comments'].apply(lambda x: re.findall('[1-9][0-9]* figures', str(x))) data = data[data['figures'].apply(len) > 0] data['figures'] = data['figures'].apply(lambda x: float(x[0].replace(' figures', '')))最后我們對(duì)論文的代碼鏈接進(jìn)行提取,為了簡(jiǎn)化任務(wù)我們只抽取github鏈接:
# 篩選包含github的論文 data_with_code = data[(data.comments.str.contains('github')==True)|(data.abstract.str.contains('github')==True) ] data_with_code['text'] = data_with_code['abstract'].fillna('') + data_with_code['comments'].fillna('')# 使用正則表達(dá)式匹配論文 pattern = '[a-zA-z]+://github[^\s]*' data_with_code['code_flag'] = data_with_code['text'].str.findall(pattern).apply(len)并對(duì)論文按照類(lèi)別進(jìn)行繪圖:
data_with_code = data_with_code[data_with_code['code_flag'] == 1] plt.figure(figsize=(12, 6)) data_with_code.groupby(['categories'])['code_flag'].count().plot(kind='bar')總結(jié)
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