我国医学团队首次绘制出肝癌转移的时空多组学演化图谱
12 月 15 日消息,復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院公眾號昨日發(fā)布博文,表示肝癌研究所樊嘉院士團隊與上海科技大學(xué)張力燁團隊及上海頓慧醫(yī)療合作,首次繪制肝癌轉(zhuǎn)移的時空多組學(xué)演化圖譜。
注:肝細胞癌(簡稱“肝癌”)是世界上最常見的惡性腫瘤之一,在我國尤為高發(fā),每年新發(fā)病例和死亡病例均占全球近一半。
手術(shù)切除是目前肝癌治療的首選方式,但 70-80% 的肝癌病人確診時已發(fā)生腫瘤播散轉(zhuǎn)移,為中晚期肝癌,失去了手術(shù)機會;即使手術(shù)切除,肝癌術(shù)后 5 年轉(zhuǎn)移復(fù)發(fā)率高達 60-70%。
肝癌的轉(zhuǎn)移復(fù)發(fā)是影響病人長期生存的主要原因,并已成為進一步提高肝癌整體療效的瓶頸。
目前肝癌轉(zhuǎn)移腫瘤的基因突變和分子表達全景圖譜仍極度缺乏,肝癌在轉(zhuǎn)移過程中的克隆選擇等演化規(guī)律尚不清晰,導(dǎo)致肝癌轉(zhuǎn)移病灶的臨床診療仍然缺乏足夠的理論指導(dǎo)。
樊嘉院士團隊整合分析多組學(xué)數(shù)據(jù),在國際上首次系統(tǒng)刻畫了肝癌轉(zhuǎn)移的時空演進全景圖譜,揭示了肝癌轉(zhuǎn)移的復(fù)雜進化軌跡和克隆選擇機制,為研發(fā)肝癌轉(zhuǎn)移預(yù)測的新標(biāo)志物和治療新靶點提供了寶貴的數(shù)據(jù)和理論基礎(chǔ)。
該研究從復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院和天津腫瘤醫(yī)院肝癌樣本庫兩萬多例肝癌手術(shù)病人中,篩選出 182 例肝細胞癌患者,并對原發(fā)灶、轉(zhuǎn)移灶和肝內(nèi)復(fù)發(fā)灶手術(shù)切除樣本回顧性多區(qū)域取樣,最終共收集 461 個石蠟包埋組織,進行基因組、轉(zhuǎn)錄組、單細胞轉(zhuǎn)錄組、空間轉(zhuǎn)錄組和數(shù)字病理等多組學(xué)聯(lián)合測序分析,為肝癌轉(zhuǎn)移異質(zhì)性研究提供了廣泛的時空多組學(xué)數(shù)據(jù)。
研究團隊進一步針對有多區(qū)域取樣測序結(jié)果的轉(zhuǎn)移灶樣本,進行轉(zhuǎn)移定植克隆模式的研究,分析發(fā)現(xiàn)約 3/4 的轉(zhuǎn)移腫瘤為單克隆定植,剩下的 1/4 為多克隆定植。
與單克隆轉(zhuǎn)移灶相比,發(fā)生多克隆轉(zhuǎn)移的病人疾病進展更快,預(yù)后更差,進一步分子機制研究發(fā)現(xiàn)缺氧信號通路活化可能是多克隆轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵驅(qū)動因素。
附上論文地址:Yunfan Sun, Pin Wu, Zefan Zhang, Zejian Wang, Kaiqian Zhou, Minfang Song, Yuan Ji, Fenglin Zang, Limu Lou, Keqiang Rao, Pengxiang Wang, Yutong Gu, Jie Gu, Binbin Lu, Limeng Chen, Xiuqi Pan, Xiaojing Zhao, Lihua Peng, Dongbing Liu, Xiaofang Chen, Kui Wu, Penghui Lin, Liang Wu, Yulin Su, Min Du, Yingyong Hou, Xinrong Yang, Shuangjian Qiu, Yinghong Shi, Huichuan Sun, Jian Zhou, Xingxu Huang, David H. Peng, Liye Zhang, Jia Fan,Integrated multi-omics profiling to dissect the spatiotemporal evolution of metastatic hepatocellular carcinoma,Cancer Cell,2023,,ISSN 1535-6108,https://doi.org/10.1016/j.ccell.2023.11.010.
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總結(jié)
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