R语言 森林图
案例
今天介紹的用于畫森林圖的R包為forestmodel,用到其中的函數forest_model,這個函數可以接收lm、glm、coxph等函數擬合的模型。我們先來畫一個cox模型的森林圖
library(forestmodel) library(survival)lung$ph.ecog <- factor(lung$ph.ecog) lung$sex <- factor(lung$sex) model <- coxph(Surv(time, status) ~ ., lung) #擬合模型 pic <- forest_model(model) pic效果圖如下:
cox效果圖展示
自定義展示內容
案例部分我們建立了一個生存分析模型,使用函數的默認設置得出了漂亮的森林圖。forest_model這個函數的參數非常多,我認為比較重要的參數為panels。panels決定我們森林圖展示的大概樣子,有默認值default_forest_panels,我們也可以自己定義panels這個參數來定制自己的森林圖。
下面重點介紹panels這個參數的設置(list with details of the panels that make up the plot )。
可以將森林圖想象為是由一系列的"列"拼起來的。我們需要通過panels這個參數定義我們的每一列是什么。如下面這張圖,1是一個空列,2是我們的變量名,3是分類變量的level&#x
總結
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