肝癌基因组的变异情况是怎样的?
生活随笔
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肝癌基因组的变异情况是怎样的?
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
研究鑒定出一系列與肝細胞癌發生相關的基因,其中β-catenin基因是最易發生突變的致癌基因,TP53基因是最易發生的抑癌基因,同時,科研人員還對肝細胞癌的三種亞型進行了分子突變層面的歸類。該研究還發現一些普遍存在的活化驅動突變,比如JAK1基因活化突變,它可導致下游一系列信號的激活,從而引發肝細胞癌。該活化基因的發現,為肝細胞癌的治療提供了一條途徑。現在多用于白血病和風濕性關節炎的藥物Tasocitinib和Ruxolitinib等JAK1酶抑制劑可作為臨床藥物在肝細胞癌治療中具有潛在的價值。
有一項最近的相關研究報道:2014年8月26日,國際生物學權威期刊《Genome Biology》在線發表了美國基因泰克公司(Genentech Inc)、香港大學、華大基因、新加坡國立大學等多家科研機構的一項最新研究成果“Diverse modes of genomic alterations in hepatocellular carcinoma”,這項研究發現了肝細胞癌中基因組變化的不同模式,影響著這種疾病的重要參與因子。除了普通的點突變、結構性變異和甲基化變化之外,還有幾種病毒相關的變化,包括基因中斷或激活、嵌合病毒-人轉錄本形成和DNA拷貝數變化。如此多的基因組事件,可能有助于這種疾病的異質性。肝細胞癌(HCC)是癌癥相關死亡的第三大原因,五年存活率小于10%。盡管每年有超過600,000新病例被確診,但是還沒有有效的靶向治療方法。HCC是高度異質性的,并與各種致病因素有關,包括乙型肝炎病毒(HBV)或丙型肝炎病毒(HCV)感染、飲酒和暴露于黃曲霉毒素和可能的氯乙烯。最近的基因組學研究揭示出一些新發現,包括TP53的頻發突變、Wnt信號成分CTNNB1和AXIN1、染色質調節因子如ARID1A和ARID2,以及靠近TERT、CCNE1和MLL4的HBV整合。這些研究在發現頻繁改變的基因方面存在不同,可能是由于研究組較?。?5名患者)和HCC固有的異質性(由于幾個相關致病因素)。例如,激活CTNNB1突變與HBV感染是相互排斥的,因此在一個HBV感染患者居多的隊列中不會太突出。因此,不同研究在低頻度人群中發現不同的基因,就不足為奇,如ARID2、ARID1A和JAK1。構造HCC完整突變景觀的另一個困難是,大多數的先前研究具有集中性,因為對于一項單一研究來說,全面的檢測多種類型的基因組變化(包括點突變、缺失、結構變化和病毒介導的基因突變)并不常見。最后,研究得出結論,異質性的HCC疾病表現出基因組變化的不同模式。除了普通的點突變、結構性變異和甲基化變化之外,有幾種病毒相關的變化,包括基因中斷或激活、嵌合病毒-人轉錄本、DNA拷貝數變化。如此多的基因組事件可能有助于HCC的異質性。
有一項最近的相關研究報道:2014年8月26日,國際生物學權威期刊《Genome Biology》在線發表了美國基因泰克公司(Genentech Inc)、香港大學、華大基因、新加坡國立大學等多家科研機構的一項最新研究成果“Diverse modes of genomic alterations in hepatocellular carcinoma”,這項研究發現了肝細胞癌中基因組變化的不同模式,影響著這種疾病的重要參與因子。除了普通的點突變、結構性變異和甲基化變化之外,還有幾種病毒相關的變化,包括基因中斷或激活、嵌合病毒-人轉錄本形成和DNA拷貝數變化。如此多的基因組事件,可能有助于這種疾病的異質性。肝細胞癌(HCC)是癌癥相關死亡的第三大原因,五年存活率小于10%。盡管每年有超過600,000新病例被確診,但是還沒有有效的靶向治療方法。HCC是高度異質性的,并與各種致病因素有關,包括乙型肝炎病毒(HBV)或丙型肝炎病毒(HCV)感染、飲酒和暴露于黃曲霉毒素和可能的氯乙烯。最近的基因組學研究揭示出一些新發現,包括TP53的頻發突變、Wnt信號成分CTNNB1和AXIN1、染色質調節因子如ARID1A和ARID2,以及靠近TERT、CCNE1和MLL4的HBV整合。這些研究在發現頻繁改變的基因方面存在不同,可能是由于研究組較?。?5名患者)和HCC固有的異質性(由于幾個相關致病因素)。例如,激活CTNNB1突變與HBV感染是相互排斥的,因此在一個HBV感染患者居多的隊列中不會太突出。因此,不同研究在低頻度人群中發現不同的基因,就不足為奇,如ARID2、ARID1A和JAK1。構造HCC完整突變景觀的另一個困難是,大多數的先前研究具有集中性,因為對于一項單一研究來說,全面的檢測多種類型的基因組變化(包括點突變、缺失、結構變化和病毒介導的基因突變)并不常見。最后,研究得出結論,異質性的HCC疾病表現出基因組變化的不同模式。除了普通的點突變、結構性變異和甲基化變化之外,有幾種病毒相關的變化,包括基因中斷或激活、嵌合病毒-人轉錄本、DNA拷貝數變化。如此多的基因組事件可能有助于HCC的異質性。
總結
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