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內(nèi)容簡介:計算機(jī)輔助藥物設(shè)計以化學(xué)和生物理論為基礎(chǔ)，通過分子模擬、預(yù)測藥物與靶點(diǎn)之間的分子識別，設(shè)計和優(yōu)化先導(dǎo)化合物，在新藥研發(fā)中發(fā)揮著不可或缺的作用。《計算機(jī)輔助藥物設(shè)計理論及應(yīng)用》針對學(xué)生在計算機(jī)輔助藥物設(shè)計學(xué)習(xí)過程中可能遇到的各種問題，介紹了數(shù)據(jù)庫、定量構(gòu)效關(guān)系、藥效團(tuán)、分子對接、虛擬篩選、同源模建、分子動力學(xué)模擬、自由能計算理論以及藥物設(shè)計過程中常用軟件和數(shù)值計算方法?！队嬎銠C(jī)輔助藥物設(shè)計理論及應(yīng)用》覆蓋全面，簡單實(shí)用，加入了大量應(yīng)用實(shí)例，穿插操作方法和技巧；每個章節(jié)自成體系，從易到難，層次分明。

作者簡介:

目錄:目錄

第一章?緒論(1)

第一節(jié)?新藥開發(fā)的基本途徑和方法(1)

第二節(jié)?計算機(jī)輔助藥物設(shè)計的常用研究方法(10)

第三節(jié)?計算機(jī)輔助藥物設(shè)計的常用軟件(14)

第四節(jié)?近年來CADD在藥物設(shè)計中的應(yīng)用實(shí)例(19)

參考文獻(xiàn)(21)

第二章?計算機(jī)輔助藥物設(shè)計的相關(guān)基礎(chǔ)(23)

第一節(jié)?計算機(jī)輔助藥物設(shè)計的生命科學(xué)基礎(chǔ)(23)

第二節(jié)?計算機(jī)輔助藥物設(shè)計的藥學(xué)基礎(chǔ)(40)

第三節(jié)?計算機(jī)輔助藥物設(shè)計的Linux基礎(chǔ)(48)

參考文獻(xiàn)(62)

第三章?常用數(shù)據(jù)庫和基礎(chǔ)軟件的使用(64)

第一節(jié)?藥物設(shè)計常用數(shù)據(jù)庫(64)

第二節(jié)?藥物和靶點(diǎn)的三維結(jié)構(gòu)顯示及繪制軟件(79)

第三節(jié)?EndNote文獻(xiàn)管理(85)

參考文獻(xiàn)(91)

第四章?基于配體的藥物分子設(shè)計(92)

第一節(jié)?定量構(gòu)效關(guān)系(QSAR)(92)

第二節(jié)?藥效團(tuán)模型(119)

參考文獻(xiàn)(125)

第五章?基于受體的藥物分子設(shè)計(129)

第一節(jié)?分子對接的原理和分類(129)

第二節(jié)?分子對接的搜索算法(130)

第三節(jié)?分子對接的打分函數(shù)(134)

第四節(jié)?分子對接的操作流程(138)

第五節(jié)?分子對接實(shí)例(144)

第六節(jié)?虛擬篩選實(shí)例(147)

參考文獻(xiàn)(153)

第六章?蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測及全新藥物設(shè)計(158)

第一節(jié)?同源建模(158)

第二節(jié)?同源模建實(shí)例(171)

第三節(jié)?蛋白質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測(178)

第四節(jié)?全新藥物設(shè)計方法(182)

參考文獻(xiàn)(186)

第七章?分子動力學(xué)模擬(190)

第一節(jié)?分子動力學(xué)模擬的原理(190)

第二節(jié)?恒溫恒壓分子動力學(xué)模擬與溶劑模型(196)

第三節(jié)?分子動力學(xué)模擬的主要步驟(201)

第四節(jié)?分子動力學(xué)模擬應(yīng)用實(shí)例(210)

參考文獻(xiàn)(231)

第八章?結(jié)合自由能的計算(234)

第一節(jié)?生物大分子體系結(jié)合自由能研究的背景及意義(234)

第二節(jié)?結(jié)合自由能計算方法(238)

第三節(jié)?基于MM/PBSA自由能算法的操作實(shí)例(241)

第四節(jié)?自由能計算實(shí)例(247)

參考文獻(xiàn)(258)

第九章?藥物靶點(diǎn)的構(gòu)象分析(260)

第一節(jié)?藥物靶點(diǎn)基礎(chǔ)(260)

第二節(jié)?粗?；Ｐ?262)

第三節(jié)?自由能曲面(275)

第四節(jié)?聚類分析(279)

第五節(jié)?自由能曲面和聚類分析實(shí)例(282)

第六節(jié)?ProDy使用(286)

參考文獻(xiàn)(291)

第十章?藥物設(shè)計常用的數(shù)值分析(295)

第一節(jié)?相關(guān)和回歸分析(295)

第二節(jié)?ROC曲線(305)

第三節(jié)?基于貝葉斯分類的類藥性預(yù)測(313)

第四節(jié)?Matlab在藥物設(shè)計中的應(yīng)用(322)

參考文獻(xiàn)(337)

附錄?常用Linux計算軟件的安裝(339)

中英文對照索引(347)

附圖(363)

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的计算机辅助药物设计 目录,计算机辅助药物设计理论及应用简介，目录书摘的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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