文献记录(part18)--3D neuron tip detection in volumetric microscopy images using an adaptive ...
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文献记录(part18)--3D neuron tip detection in volumetric microscopy images using an adaptive ...
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關鍵詞:神經元提示;神經元跟蹤;自適應射線發射模型
備注:…不知道在說啥
3D neuron tip detection in volumetric microscopy images using an adaptive ray-shooting model
摘要
3D神經元提示可以作為神經元追蹤應用的種子點。在此基礎上,提出了一種射線發射模型,通過分析神經元尖端候選點附近的強度分布來檢測神經元尖端。然而,該模型中需要考慮的射線的長度和z -切片的數量是固定的經驗數字,因此它不能處理神經元直徑變化很大的挑戰性數據集。
本文提出了一種自適應射線發射模型,根據多模板快速移動(MSFM)方法獲得的神經元的局部直徑,改變發射射線的長度和相鄰切片的數目。
實驗結果表明,在具有挑戰性的數據集上,該方法可以將檢測正確率提高10%左右。
簡介
在神經生物學研究中,在大數據集的體積顯微圖像上進行三維神經元重建(神經追蹤)對于理解大腦回路如何工作至關重要[1 - 3,39]。神經元示蹤方法是基于神經元具有分支樹結構這一事實,然后重建神經元網絡的問題可以歸結為確定神經元分支的去向以及它們如何進一步分支成更細的分枝。
現有的大多數神經元追蹤方法[1,3,5]都需要一組理想的種子。最直觀的種子點是神經元結構的起始點和結束點,即神經元尖端(如圖1所示)。一旦給出神經元尖端,許多神經元追蹤工具,如Va
總結
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